Cronograma IBMC turma 2016B

Cronograma IBMC 2016_2 (Parcial)

DIA LETIVO	DATA	ASSUNTO	HORÁRIO
1	9/11	Origem da vida.	9-12 h
2	16/11	Componentes celulares e estrutura dos eucariotos e procariotos; membranas celulares	9-12 h
3	23/07	O núcleo e organização e estrutura dos genes e genoma. Replicação do DNA	9-12 h
4	30/11	Transcrição e processamento	9-12 h
5	07/12	Tradução e Controle da expressão gênica procariotos	9-12 h
6	14/12	Controle da expressão gênica em eucariotos; Técnicas de biologia molecular (PCR, sequenciamento, outras)	9-12 h
7	21/12	1ª. AVALIAÇÃO	9-12 h

Emergência rápida da vida: novas evidências

O artigo sobre a origem da vida que mencionei na aula está no link abaixo, que deve ser acessado quando o computador ou celular estiver no wireless da UFCG.

O título e autores estão a seguir, assim como o link

Rapid emergence of life shown by discovery of 3,700-million-year-old microbial structures

Allen P. Nutman, Vickie C. Bennett, Clark R. L. Friend, Martin J. Van Kranendonk & Allan R. Chivas

doi:10.1038/nature19355    

Sites e referências para CRISPR-Cas9 (e para gene drive) que explicam o processo de forma mais simplificada

Uma animação decente: https://www.youtube.com/watch?v=ZJ-ChS9roQ0#t=42

Um texto bastante claro que mostra como funciona a edição: http://www.abc.net.au/news/2016-04-07/crispr-gene-editing-technology-explainer/7217782

Outro bem feito é o da Harvard: http://sitn.hms.harvard.edu/flash/2014/crispr-a-game-changing-genetic-engineering-technique/  que tem também valiosos links do lado direito.

Uma dúvida (desconhecimento, mesmo): como é que se transformam os organismos usando estas enzimas? Neste site tem o caminho prático - http://www.clontech.com/BR/Products/Genome_Editing/CRISPR_Cas9/Resources/CRISPR_Cas9_Gesicles_Overview?sitex=10028:22372:US&PEBCL1=VwkwGagonNRfuk2X5wr3isWu3A&PEBCL1_pses=ZG62BDA5E0C76ED530C683B864608DA30F921905ACF78146E99DFCA29D8D39D00AFDDF40F56B2F0DFA033A8A409A93BBE5C907292A9540E635  Do lado esquerdo do site tem uma série de links técnicos que explicam tudo direitinho que está mostrado no vídeo, mas as “gesicles” não são a única forma de transformar células. Além disso, depois de transformadas, as células precisam regenerar o organismo (se se deseja construir um OGM) ou precisam se multiplicar e diferenciar em muitos diferentes tipos celulares se a ideia é regenerar tecidos ou substituir células num organismo pré-existente (não sei até que ponto isso já é possível). E isso não está explicado.

O artigo que descreve as “gesicles” é este: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3182359/  . Não é o artigo original, mas um comentário, entretanto é muito claro e tem figuras explicativas.

Aplicações veterinárias e outras

Este artigo revê o uso em bovinos - http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10577-014-9452-6 (via Capes). A leitura não é fácil e para CRISPR e outras endonucleases o assuntosó é tratado da página 23 em diante.

Este link é para revisão em plantas, mas é superior ao de bovinos - https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25536441

Pode ser interessante ler esta revisão geral - Genome Editing with Engineered Nucleases in Economically Important Animals and Plants: State of the Art in the Research Pipeline. Sovová T, Kerins G, Demnerová K, Ovesná J. Curr Issues Mol Biol. 2016 Jun 2;21:41-62. [Epub ahead of print] link http://www.horizonpress.com/cimb/v/v21/41.pdf

Depois de ler e ver tudo o que está acima, vale a pena ler a revisão - Genome Engineering with Targetable Nucleases  http://www.annualreviews.org/doi/pdf/10.1146/annurev-biochem-060713-035418 , mas tem 35 páginas... Apesar disso, o assunto está muito bem dividido entre as diversas endonucleases e a leitura acaba compensando.

Alteração do cronograma 2016.1 IBMC

Caros.

Por razão dos bloqueios e do feriado de 12 de outubro, o cronograma da disciplina IBMC teve que ser revisto (http://genmol.blogspot.com.br/2016/07/cronograma-ibcm-20161.html) . Por favor, anotem com cuidado as novas aulas e provas.

Esta semana a Nature publicou um estudo que mostra bactérias de 3,7 bilhões de anos em sedimentos da Groenlândia, o que confirma evidências indiretas anteriores e está de acordo com o relógio molecular que indica o aparecimento da vida a pouco mais de 4 bilhões de anos.

NATURE | LETTER

Rapid emergence of life shown by discovery of 3,700-million-year-old microbial structures

Allen P. Nutman, Vickie C. Bennett, Clark R. L. Friend,Martin J. Van Kranendonk & Allan R. Chivas

Nature (2016) doi:10.1038/nature19355

Received 11 October 2015 Accepted 11 August 2016 Published online 31 August 2016

Link: http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature19355.html?WT.ec_id=NATURE-20160901&spMailingID=52195183&spUserID=MjA1NTMwNTExNwS2&spJobID=1000097132&spReportId=MTAwMDA5NzEzMgS2

(Obs: de dentro da rede da UFCG é possível baixar ao artigo na íntegra)

Cronograma IBCM 2016_1

DIA LETIVO	DATA	ASSUNTO	HORÁRIO
1	22/06	Origem da vida: vírus e células; componentes celulares e estrutura dos eucariotos e procariotos	9-12 h
2	29/06	Componentes celulares e estrutura dos eucariotos e procariotos (finalização); membranas celulares	9-12 h
3	06/07	O núcleo e organização e estrutura dos genes e genoma	9-12 h
4	13/07	Replicação do DNA	9-12 h
5	20/07	Transcrição e processamento	9-12 h
6	27/03	Tradução e Controle da expressão gênica procariotos	9-12 h
7	03/08	Controle da expressão gênica em eucariotos	9-12 h
8	10/08	Técnicas de biologia molecular (PCR, sequenciamento, outras)	9-12 h
9	17/08	1ª. AVALIAÇÃO
10	24/08	Mitocôndria e Peroxissomos	9-11 h
	31/08	Não houve aulas	9-11 h
	07/09	Feriado nacional	9-12 h
11	13/09	Comunicação intercelular e transdução de sinal	18-20:30 h
12	21/09	Não houve aula	9-12 h
13	27/09	Sistema de endomembranas	18-20:30 h
14	28/09	Mitose-Meiose Apoptose	9-12 h
15	05/10	Citoesqueleto	9-12 h
16	11/10	2ª. AVALIAÇÃO	18-20:00h
17	14/10	REPOSIÇÃO	14:00-16:00
18	26/10	EXAME FINAL	9-12 h

Entre o dia 14 e o dia 26 poderá ser agendada uma ou mais assistências com os monitores,

Seimnários da PG BCM - cronograma de apresentações revisto

Todos os seminários devem ter uma abordagem molecular e celular aprofundada. Livros podem ajudar em muitos casos, mas por vezes o assunto só aparece em detalhe em revisões publicadas em revistas especializadas. Cada seminário deverá tomar 40min., exceto o de contração muscular, que pode se estender para 1h30 min. O conjunto de seminários será apresentado em dois dias de aula.

Primeiro bloco (15 de junho à tarde)

Beatriz – Como as células se aderem umas às outras? Desmossomos, gap junctions, etc.

Aline Ferreira – Como se dá o crossing-over na meiose?

Natanael - Como o linfócito T citotóxico dispara a apoptose na célula alvo?

Segundo bloco (16 de junho pela manhã)

Lídio Ricardo - Como se dá o acoplamento do ribossomo à membrana do retículo endoplasmático e qual o destino da proteína sintetizada?

Marília e Raquel – Acoplamento excitação-contração muscular: do sinal elétrico que se propaga no axônio à contração muscular

Seminários da PG - BMC

Para que todos possam ler o assunto e não apenas os responsáveis pelos seminários...

Seminários para o dia 13 de abril

Aline Alves	As hipóteses de origem dos vírus: argumentos (há no blog GenMol uma sinopse traduzida da Nature)
Maria das Graças	Como a cromatina se descondensa e re-condensa na divisão celular em mamíferos (não precisa falar sobre as várias fases da mitose, só o mecanismo molecular da condensação)
Carla Lauise	Como se replicam os vírus HIV e DEN
Laysa Freire	Cinco exemplos de antibióticos que bloqueiam a tradução e seus mecanismos de ação (Os antibióticos podem ser contra procariotos ou eucariotos)