sábado, 3 de dezembro de 2011

Cobertura e identidade nos resultados do blastn


Pergunta: Gostaria de saber se o query coverage e o max ident podem dar diferentes de 100%, no meu caso foi de 96% e 99% respectivamente. Abaixo encontrasse meu organismo encontrado e a sequência a mim enviada:

Dictyostelium discoideum AX4 hypothetical protein (DDB_G0282759) mRNA, complete cds
 2619
 96%
 0.0
 99%

Resposta: Sim, os dois podem ser diferentes de 100%. No caso de sua sequência, ela não foi obtida do banco de dados do NCBI, então pode ter trechos (possívelmente 5´e 3´) que não são idênticos à sequência depositada.

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